以下内容参考了博客https://www.cnblogs.com/bio-mary/p/12818888.html、前研究组师妹的总结资料和MC...
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mcmctree进行分化时间的估算 -
SyRI鉴定SVSynteny and Rearrangement Identifier (Syri), 鉴定基因组间SV。以全基因组比对结果作为输入，可识别不...
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【如何拆分多倍体亚基因组？】SubPhaser软件SubPhaser原文链接：https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.18173[...
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【报告笔记】基因组组装的最后挑战-T2T
长读长组装发展 2012：三代组装、二代校正；耗资源，适合小基因组，如细菌，4-15%错误率 2013：三代组装、三代校正；仍然只适用小的 20...
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HiFi全基因组测序技术HIFI技术的简介 HiFi reads（High fidelity reads） 是Sequel II 三代测序平台推出的兼顾长读长和高准确度...
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用hifiasm组装基因组
hifiasm大概是目前为止支持PacBio HiFi数据组装的所有软件中表现最优异的软件了。它不但能输出primary assembly re...
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SVfinder找染色体结构变异染色体结构变异(sv)包括缺失、重复、倒位、易位、插入等。 SVfinder主要是基于Python开发的，能对全基因组测序分析出SV结果。 SV...
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基因家族的收缩与扩张基因家族指来自诸多物种的MRCA（Most Recent Common Ancestor，最近共同祖先）的同一个始祖基因演化而来的一组基因。 研...
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MCScanX共线性分析共线性 共线性片段是指一个同一个物种内部或者两个物种之间，由基因组复制、染色体复制、大片段复制以及物种分化而产生的大片段同源现象。同源片段内部基...
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jcvi(MCscan Python 版) 共线性分析jcvi网址：MCscan (Python version) · tanghaibao/jcvi Wiki · GitHub[https://g...
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