老规矩，先奉上学习资料链接： https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/...
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2023-MutationalPatterns包学习笔记（一） -
跟着NC做基因组数据分析本期内容为[跟着NC做基因组数据分析]，这是你需要的教程，对你一定有帮助。 前言今天花费找文章，看到一篇关于基因组，组装的文章，主要是里面的图吸...
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外显子WES数据检测CNV方法梳理与软件汇总总结（看的有限）： 1. 大部分方法为基于深度（划分区间检测）的方法（FPKM、区域碱基数的类似FPKM算法）。 2.大部分软件会使用对照样本作...
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用R语言对vcf文件进行数据挖掘.5 vcf可视化1目录 前言[http://08643.cn/p/729673778e43] 方法简介[https://www.jianshu.c...
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取两个VCF的差集
参考：https://www.biostars.org/p/113509/#113509[https://www.biostars.org/p/...
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家系分析软件汇总
作者：charon审稿：童蒙编辑：amethyst 二代测序技术蓬勃发展，已经用于临床上辅助疾病诊断，利用二代测序数据挖掘孟德尔遗传病相关的基因...
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单个vcf文件转maf文件，单样本maf合并成多样本maf文件在网上偶然看见了maftools，想用自己的vcf文件尝试，因此在网上找了教程来进行这一转换。 本文章旨在解决两个问题，一，vcf 转maf过程...
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如何用Conda安装GATK？刘小泽写于2020.9.2现在conda的使用越来越方便，用的人也越来越多，就是因为学习成本简单，比较容易上手，并且不需要root权限以及修改b...
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neoantigen计算机预测的一般流程简介
首先,简单介绍一下新抗原(neoantigen)的含义,它是肿瘤细胞特异性表达而正常细胞(除了睾丸之外)的一种抗原性多肽, 它能被免疫系统的T细...
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肿瘤新生抗原预测软件和参数选择癌症疫苗靶向肿瘤细胞的抗原可以大致分为两类：肿瘤相关性抗原（tumor-associatied self-antigen）以及肿瘤特异性抗原（t...
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