测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序...
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TCGA数据差异分析后生存分析（批量单因素cox回归/Lasso筛选，多因素cox建模，时间依赖ROC曲线及KM plot可视化） -
ChIP-seq基础入门理解ChIP-Seq 到了目前这个水平，我学习新的高通量数据分析流程时已经不再考虑代码应该如何写的问题了。我更多要去考虑一个技术的目的和意义。 ...
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整合QC质控结果的利器——MultiQC一、MultiQC介绍 NGS技术的进步催生了新的实验设计、分析类型和极高通量测序数据的生成。对于这些数据的质量评估，每一步分析结果的评估是后续...
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单细胞转录组-试运行
以Illumina测序仪说明二代测序的一般流程: （1）文库制备 将DNA用雾化或超声波随机片段化成几百碱基或更短的小片段。用聚合酶和外切核酸酶...
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【RNA-seq自学10】总结篇1、什么情况下用RNAseq RNAseq是一种高通量测序技术。它可以帮助我们理解在各种比较条件下，所有基因的表达情况的差异。简单的理解，就是R...
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处理NGS的新神器systemPipeR首先附上软件链接：https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/systemP...
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WGS实战：从raw reads到vcf实操一个WGS项目，从原始测序数据到比对，再到call变异，以及vcf文件的质控。 软件准备 samtools sratoolskit bcft...
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组学工具合集
组学工具合集 整理了一些目前知道的与组学相关的工具，可能不全面，欢迎补充 基因组学 一代组装 Celera Assembler: 最具代表性的工...
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ZT:lncrna分析流程
author:风吹过的94data:2016-051.QC2.比对(tophat2) 3.组装(cufflinks) 4.合并(cuffmerg...
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TCGA专用转录组流程代码大放送 - 生信技能树
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