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lncRNA具有一系列独特特性,这些特性与编码蛋白质的mRNA有或多或少的区别。需要将鉴定出的新lncRNA与数据库中的lncRNA以及蛋白质编...
这个时候已经不是表达矩阵的事情了,要从新从fastq测序数据开始。对测序后的fastq数据进行转录本的组装。基于组装后的转录本,通过数据库注释去...
因为样本数量比较可观,所以可以进行WGCNA分析。这里是并不需要选取所有的基因来做WGCNA分析,挑选的标准可以是top变异程度大的基因集合,或...
很明显,得到了表达矩阵之后,根据上面的样本信息,可以按照年龄,性别,取样部位来进行分组找差异??梢圆慰迹篽ttps://github.com/j...
SRA—>FASTQ—>BAM—>COUNTS 这几个步骤而已,中间穿插一些质控的手段,每个步骤选择好合适的软件即可??梢圆慰迹阂桓鲋参镒甲橄?..
下载原始测序数据: 在GEO数据库搜索GSE87182, 这里没有直接给出ftp地址,需要先从BioProject找到SRA号,可以得到RNA-...
“ Annotation and cluster analysis of spatiotemporal- and sex-related lnc...