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答读者问(8)：如何批量查询marker基因(对应的蛋白)会不会在膜上表达？做实验的朋友们对这个问题应该是很感兴趣的，因为涉及到后续能不能实验验证。 一般的做法是拿基因名或者蛋白名去查文献，查网站。我知道的：unipro...
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【单细胞高级绘图】11.marker展示_分组气泡图忙里偷闲，整理了一套绘图代码，代码300行，效果如上图所示：其实就是把单细胞转录组中常见的气泡图根据分组信息展开了，代码目前适用于分组后leve...
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如何获取kegg通路的基因列表
如何获取kegg通路的基因列表？相信很多人都有这个疑惑。 哪些时候需要知道通路的基因列表？举两个例子： 在找差异基因这一步，只想针对特定通路的基...
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一个对接CellPhoneDB的R包首先祝大家新年快乐！新的一年paper多多，顺顺利利！ cpplot:Visualize the results of cell-cell co...
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CellPhoneDB三个版本（V2、V3、V4）之间的对比
上个月在小组会上做了一期细胞互作的分享，目前剪了一部分出来。后续还有cellchat、nichenet以及演示的部分，等剪辑好了再发。 视频介绍...
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10套代码让你学会单细胞高级绘图
4000+人次获取代码 高级绘图这个系列已经出了10期了，最开始的出发点是想把用过的不错的代码整理出来，方便自己也帮助大家。从第1篇300+小伙...
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【单细胞高级绘图】10.KEGG富集结果的圆圈图本次教程的figure仍然是读者求助的图，算得上是kegg富集图的新流派。据我的调查，该图应该是基迪奥云-平-台首创(https://www.o...
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【单细胞高级绘图】09.细胞通讯_两组比较_连线图上周一位读者联系我，让我帮忙发一个绘图的单子。在朋友圈发单后，感兴趣的朋友很多，有十几位还私聊我让我分享一下代码，可见大家还是很感兴趣的。不过等...
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【单细胞高级绘图】08.细胞通讯_两组比较_气泡图细胞通讯分析，我很早之前就写过，当时详细介绍了CellPhoneDB的原理、实操、可视化。单细胞分析实录(18): 基于CellPhoneDB的...
