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  • MUMmer输出delta文件后，通过delta-filter文件delta进一步整理，运行5天了，输出文件一直是0，也没有报错，请问一下这种情况正常吗

    MUMMER 两个基因组间比较

    最近在看泛基因组学，学习了下MUMMER软件（http://mummer.sourceforge.net/manual/）：适用于两个全基因组（基因草图or完整基因组）的快速...

  • 你好，你的结果最后跑出来了吗？我也遇到你一样的情况

    生信分析|MUMmer4+SyRi

    前言 Comparing SVs between two genome：use whole-genome alignment 1、MUMmer4 MUMmer is a sy...

  • @xuzhougeng MUMmer输出delta文件后，通过delta-filter文件delta进一步整理，运行5天了，输出文件一直是0，也没有报错，请问一下这种情况正常吗

    应该是最新最详细的MUMmer中文使用说明

    如何使用MUMmer比对大片段序列 测序技术刚开始发展的时候，大家得到的序列都是单个基因的长度，所以一般都是逐个基因的比较，用的都是BLAST或FASTA通过逐个基因联配的方...

  • 请问一下我的delta文件大概5G，delta-filter运行5天了 输出文件一直是0，也没有报错这种情况正常吗

    MUMMER 两个基因组间比较

    MUMmer出现的历史背景测序技术刚开始发展的时候，大家得到的序列都是单个基因的长度，所以一般都是逐个基因的比较，用的都是BLAST或FASTA通过逐个基因联配的方式搜索数据...

  • @就是大饼 请问一下，如果有多个同源基因对，是不是在运行hyphy之前要对每对同源基因对进行构树，然后计算每对同源基因对的选择压力

    hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)

    官网：http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...

  • 我也遇到了同样的问题，应该是蛋白序列出了问题，用软件把cds转成蛋白序列在往下做

    hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)

    官网：http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...

  • 您上面的例子蛋白序列比对和构树都是用一个物种的蛋白吗？

    hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)

    官网：http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...

  • GWAS分析-说人话（1）什么是GWAS，都分析啥？

    前言 “没有什么比知道我们自己正在做什么更重要了” ——小史，20191121之感触 这...