tags: RCategories: 遗传参数 ···param= function(){ GA=as.matrix(read.table("GA.csv",h=F,sep=...
发简信
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计算重复力模型结果的遗传力及相关R代码
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TBtools | 基因家族分析 (进化树、Motifs、结构域)再次体验一下TBtools的强大。使用TBtools对基因家族进行分析，进化树、Motifs 、结构域和基因结构多图合一。 一、数据准备 1.基因组组装结果fasta格式 2...
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使用BioAider快速生成核苷酸+氨基酸序列同一性矩阵在进行序列分析时，难免要做一张序列两两比较的同一性（大致和相似性差不多）表，比如下面这样的： 单一核苷酸或者氨基酸序列同一性表比较好办，可以通过Geneious （付费软件）...
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中国农业科学院 生物学博士在读
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单个基因的生物信息学分析(2)-蛋白质结构域预测本期的主题仍然属于《单个基因的生物信息学分析》，主要讲解介绍一下单个蛋白质结构域分析。 网站链接如下：InterPro 打开主页面显示如图1，注意的是，一次只能进行一个蛋白序...
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CFVisual绘制Motif+基因结构+结构域+进化树+启动子图的单独或组合图1. 软件简介 CFVisual_V2.1软件是一款借助Python语言的matplotlib库和PySide2库进行生物序列结构绘图的数据可视化软件，主要用于生物信...
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【HMMSCAN】使用pfam数据库对多序列文件进行结构域注释
写在前面 做基因功能的人都会特别注意基因上有什么功能结构域，通常我们认为，结构域决定了这个基因的功能。随着高通量测序技术的发展，我们完全可以通过一级序列来预测该基因的结构域，...
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【陪你学·生信】十、编辑对多序列比对结果
?一般多序列比对的结果都需要进行编辑再进行下一步分析。 这个推送中用于举例操作的比对结果可以在网站下载： http://www.tcoffee.org/dummy_aln.h...
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蛋白质序列比对与蛋白质二级结构预测#什么是蛋白质二级结构？ 按照结构层次划分，蛋白质结构可以分为一级结构、二级结构、三级结构、四级结构： 蛋白质二级结构（secondary structure of prot...
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生信小白如何绘制蛋白序列的二级结构可视化图大家经常在文献中看到非常漂亮的多序列比对图，上面标注了各种蛋白二级结构的信息，现在小白将目前见过的最好看的序列比对图和蛋白二级结构的组合图的作图方法作分享，希望对大家的科研工...
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2022-04-27使用 GSDS 绘制基因结构图GSDS[http://gsds.cbi.pku.edu.cn/] 是由北京大学生物信息学中心提供的用于显示基因外显子、内含子、保守元件的组成和位置的一个在线服务，全英文界面...
