Cutadapt安装 基本命令 例子： 常用参数 参数详解 Removing adapters Adapter 移除 Anchored 5’ adapters：adapter...
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cutadapt 使用详解 -
【生信工具】seqkit-fa&fq文件处理利器作为生信入门训练，我们常用perl python等脚本语言实现对基因组文件的处理，练习常规的文本文件处理。最近再做单细胞方面的技术开发，需要自己手动合成一个嵌合两种物种的基因...
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Conda安装qiime2（目前最有效的方法）一、环境 linux-ubuntuanaconda3/miniconda 二、实操演示 1.conda是安装QIIME2的首选工具，但是很多国内的朋友苦于无法链接网络问题导致...
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5. 基于OTUs的alpha多样性指数计算和可视化简介 1. 物种丰富度指数(Species richness)：群落中丰度大于0的物种数之和，一般用Observed OTU(observed species)表示，只有物种...
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R包安装、卸载的多种方式本期内容 查看及修改R包的安装路径 修改安装包的默认镜像源 R包的多种安装方式 R包卸载 以下如无特殊说明，命令都是在R中运行 查看及修改R包的安装路径 重启R，再次查看安装...
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R及R包安装、更新、卸载、删除
更新R 更新R包 更新所有R包如果用的是Rstudio，要更新library里所有包，一种方法是点击Tools，选择Check for Package Updates即可。 ...
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楼主您好，我在测试的时候最后四行代码出现报错
Error: object 'rowtype' not found
Error: object 'coltype' not foundComplexheatmap::pheatmap绘图字体设置
ComplexHeatmap是一个很好用的绘制热图的R包。这篇文章主要介绍Complexheatmap::pheatmap绘图字体设置。在原函数中没有设置字体的参数。查看有关...
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Complexheatmap::pheatmap绘图字体设置ComplexHeatmap是一个很好用的绘制热图的R包。这篇文章主要介绍Complexheatmap::pheatmap绘图字体设置。在原函数中没有设置字体的参数。查看有关...
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perl脚本练习：fasta格式与tab格式序列之间相互转换(2)(适用范围更广)
前言 我的认知里，fasta格式中“>”只会位于行首。但是我写脚本用的示例数据里出两行特殊id。这两个id中除了行首的“>”，中间还有“>”，造成原脚本不能适用。所以在脚本里...
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生信分析之基因富集分析（GeneSet Enrichment Analysis)
01 基因富集分析基本概念 今天我们来讲一讲什么是基因富集分析 首先我们要抓住一个核心，那就是： “将我们挑出来的基因归归类，聚类分析，看看这些基因的功能和我们的研究是否具有...
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微生物组16S rRNA数据分析小结：从OTU table到marker物种笔记内容：由二代测序产生的序列数据（.fastq）到OTU table， 距离矩阵，物种多样性指数，序列的进化树及物种注释信息的可分析数据，为常规分析流程?？梢允褂胾sear...
