LD概念 连锁不平衡(linkage disequilibrium, LD)也叫等位基因关联，是指不同座位的两个等位基因出现在一条染色体上的频率与随机组合出现的频率不一致的情...
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重测序分析（12）群体进化分析之LD衰减分析 -
学生信为什么要学Linux常见的操作系统 Windows Mac OS (distant cousin to Linux) Android iOS Linux OS (Linux kernel + G...
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重测序分析（13）群体进化分析之群体选择分析
进化论 - 达尔文进化论 生物物种存在广泛变异 自然选择，适者生存和繁殖，不适者淘汰 生命是单起源的 - 中性学说 大多数突变是“中性”的 进化主要是中性突变进行随机的遗传漂...
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连雨不知春去，一晴方觉夏深
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群体遗传学必备知识锦囊群体遗传学应知应会 今天分享一篇关于群体遗传学的笔记，主要参考了网络公开资料以及公开发表的文献，包含群体遗传的概述、研究方法、应用领域、分析流程、统计学原理、群体结构评估等。...
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群体进化分析--基因流及群体历史分析——我愿称之为史上最全基因流（也称基因迁移）是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因，是遗传变异一个非常重要的来源，...
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2023-03-21 | Dsuite做D及f4-ratio统计量Dsuite原理： D值（即ABBA统计量）和f4-ratio统计可以表示为适用于四个分类群的双等位基因SNP：P1,P2,P3,O，拓扑是 (((P1,P2),P3),O)...
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群体遗传学与重测序分析分子层面对生物的研究，在个体水平上主要是看单个基因的变化以及全转录本的变化（RNA-seq）；在对个体的研究的基础上，开始了群体水平的研究。如果说常规的遗传学主要的研究对象是...
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遗传统计|Tajima D, Watterson θw和π的计算
在描述基因组受选择情况时，通?；岵扇∫恍┲副昀春饬科湓谘莼讨惺艿胶沃肿匀谎≡?。在这其中Tajima D是常见的衡量物种自然选择的指标。Tajima’s D是由日本研究员田...
