发简信
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用MrBayes构建系统发育树操作步骤整理总结
最近在学习构建进化树，尝试了用PHYML构建ML树和用MrBayes构建贝叶斯树，因为构建ML树时用的是网站的PHYML进行的，操作简便，所以就未做整理，只详细整理了一下贝叶...
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kaks calculator批量计算多个基因的选择压力kaks值
欢迎来到"bio生物信息"的世界 今天给大家带来“批量计算kaks值”的技能。 关于kaks的背景知识我就不介绍了，感兴趣的自行搜索，这里直接开始讲怎么批量计算kaks值。 ...
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linux脚本 | 线粒体组基因提取合并
介绍 基于线粒体基因组进行构树时，一般仅以其中的编码基因(需要的话也可以提取rRNA)完成。之就需要对每个物种的线粒体基因组的每个基因序列进行提取，合并。无论是自己拼装的还是...
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叶绿体线粒体测序能发啥？这篇5分多的JXB文章为我指明方向题目：Zygnema circumcarinatumUTEX 1559 chloroplast and mitochondrial genomes provide insig...
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【工具-0】【转】生物学软件大全
欢迎关注公众号：oddxix 1.三维分子类 RASMOL：观看生物分子3D微观立体结构 RasTop：为RasMol 2.7.1的图形用户界面软件 CHIME：直接在浏览器...
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最全Bedtools使用说明--只看本文就够了1 Bedtools:一个强大的基因组算法工具集 Bedtools是由犹他大学昆兰实验室开发的基因组算法工具集，它堪称是基因组分析工具中的瑞士军刀。Bedtools可以对基因...
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山河已秋，人间已晚
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interproscan 安装及运行错误调试
interproscan interproscan 是个基因注释工具，可以一次运行实现多个数据库的注释。用户既可以提交蛋白序列也可以提交核酸序列，还可以对输出格式进行设置。 ...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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如何对基因组序列进行注释基因组组装完成后，或者是完成了草图，就不可避免遇到一个问题，需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型，有三种策略： 从头注释(de novo prediction...
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叶绿体基因组拼装软件NOVOPlasty的下载使用
第一步下载NOVOPlasty 在https://anaconda.org/bioconda/novoplasty/files?sort=ndownloads&sort_or...
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生信log21|基因组成圈了吗？-拼接路径可视化软件Bandage结果详解在实验室经常听到师兄师姐评估基因组提到一个点就是，基因组能拼成圈吗，当时还是生信小白（现在是个资深小白）的我仅仅见识过circos的华丽图片，以为他们口中所说的成圈是circ...
