工具名称简介运行命令BaitDesigner (Picard)设计杂交捕获反应设计杂交探针用的" java -jar picard.jar BaitDesigner \ ...
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GATK参考序列的操作（操作FASTA格式的序列）
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google cloud storage linux 命令行操作1、首先需要进行gsutil的安装 推荐使用Pypi进行安装，感谢伟大的pip pip install gsutil 2、找到对方分享链接中的gsutil 链接 3. 使用命...
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google cloud storage介绍google cloud platform 包括了四个部分，高性能虚拟机，云存储，sql,以及app虚拟机。由于google的广泛使用，广大大数据工作者都开始将数据转到clo...
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2018-08-18
使用GEOquery包 肖恩戴维斯 2014年9月21日 1GEO概述 1.1平台 1.2样品 1.3系列 1.4数据集 2使用GEOquery入门 3GEOquery数据结...
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SNP连锁不平衡图（LD）可视化R包LDheatmap的使用理解SNPs之间的联系或连锁不平衡（LD）模式对于单体型的选择具有重要作用，然而，对于密集的SNP图谱，随着区域内SNPs数量的增加，很难直接从复杂的VCF文件来看出SNPs...
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VIM 配置 .vimrc
从终端打开配置文件： vim ~/.vimrc 1 添加如下代码： ·1. set tabstop=4 2. set softtabstop=4 3. set shiftwi...
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sed命令:删除匹配行和替换
删除以a开头的行 [cpp]view plaincopysed-i'/^a.*/d'tmp.txt -i 表示操作在源文件上生效.否则操作内存中数据,并不写入文件中. 在分号...
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pybedtools文档-平行在外显子和内含子中计算reads数
本例子展示的是如何在内含子和外显子中统计reads数量。不但包括了这个内容，还包括了其他的命名展示。例如 1、BAM file support (for more, seeW...
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pybedtools文档--筛选
1、BedTool.filter(func,*args,**kwargs)[source] 根据用户定义的功能进行特征的筛选，使func对Bedtool目标中的每一个特征进行...
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pybedtools文档--读取和写出
一、读取 pybedtools主要是使用BedTool对所有参考格式进行读取, 不但能够读取bed，gff, gtf，还可以读取gz等格式。 from pybedtools ...
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pybedtools文档--概述
BedTools被广泛应用于基因组数据的区间操作。而pybedtools则扩增bedtools的功能，并将其包装成python可用的特征水平操作。 全部的在线文档见：http...
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【bedtools教程】-annotate功能
annotate bedtoolsannotate, well, annotates one BED/VCF/GFF file with the coverage and n...
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如果你是程序员，或者有一颗喜欢写程序的心，喜欢分享技术干货、项目经验、程序员日常囧事等等，欢迎投稿《程序员》专题。 专题主编：小彤花园 http://08643.cn/users/4a4eb4feee62/ 【程序员】专题拒稿指北：http://08643.cn/p/7c8b33b5f63b 投稿须知： 1.收录相关技术文章，但不限于技术，也可以是项目经验类的文章和程序员日常。 2.文章內不得有任何推广信息。包括但不限于公众号、微博、微信，更不得在通过投稿后再修改文章加入推广信息。你可以将这些推广以及个人信息放在个人主页介绍里。 3.字数极少，段落混乱，大段代码没有放到代码框的文章不收录 4.不相关的内容不收录，请确认文章内容和本专题相关 目前针对优质作者及爱好者，开设了官方程序员微信群，希望加入请发简信给主编小彤花园索取个人微信，主编会将你加入到【程序员】微信群，分享内容，收获知识。添加微信时备注昵称。
