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    (收藏贴)FastTree使用自我总结教程贴

    Step 1,使用序列比对工具进行序列比对,这里笔者用的mafft(官网说明:https://mafft.cbrc.jp/alignment/software/) 官方:ma...

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    教你如何使用u盘安装Linux系统

    小伙伴你们知道怎么使用u盘来安装Linux系统吗?可能大多数的人都好还不太清楚,不知道的也没关系哟,小编这就来将u盘安装Linux系统的操作步骤来带给你们。 小伙伴之所以知道...

  • 二代测序质控

    测序数据质控统计--微不足道?意义重大!转https://genedock.com/article/2017/09/15/%E6%B5%8B%E5%BA%8F%E6%95%B...

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    RNA-Seq数据分析—cutadapt质量控制

    可对fastq数据进行质量控制的软件有很多,今天我们先学习cutadapt。 安装 官方帮助文档 常用参数 我处理的数据 我的数据(GSE176393)是应用Illumina...

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    转录组数据分析——原始数据质量控制(QC)

    获得转录组数据(.fastq文件)后的第一步就是对原始数据的质量控制。 目的 质量控制的目的是全面查看原始数据的质量,内容包括碱基质量评估、GC含量检验、N碱基数量评估、TC...

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    2020-12-24 二代测序结果文件大小问题

    问题是,二代下机数据的Raw Reads乘以测序长度后为什么不等于Raw Base? Raw Reads简称为RR,Raw Base简称为RB。图中RR是34040437个,...

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    Fastq BAM VCF

    生信分析的旅程大致是,接收fastq,获得bam,然后vcf FASTQ文件是什么?通常人们会拿着DNA的碎纸片,由碎纸片扫描的图片文件,转化成文本文件就是FASTQ 产生这...