2022年4月,TCGA数据库进行了一次更新,原来的HT-RNASeq数据被替换成了Star-RNASeq,这导致原有的TCGAbiolinks包能正常下载数据,但是不能用G...
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首先创建一个项目目录wes和存放每个步骤生成文件的子目录raw, clean, align, genome, hg19_VCF 此流程包含两个raw外显子测序文件:wes.1...
一、下载安装Aspera Connect Linux系统下的Aspera Connect安装(Windows下的Aspera Connect安装参考)。查看最新版本的Aspe...
Author: Zuguang Gu ( z.gu@dkfz.de )翻译:诗翔Date: 2018-10-30 图形注释非常常用。热图注释唯一相同的特征是它们对齐热图的列或...
新手,刚做完一个ChIP-Seq项目的分析,来记录一下,会分好几篇。 首先是下机数据fastqc之后会生成一个html格式的报告,根据报告可以看出自己数据的特点,便于之后cl...
什么是桑基图 ?;迹⊿ankey diagram),即?;芰糠至魍?,也叫?;芰科胶馔?。它是一种特定类型的流程图,图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小,比较适用于用户流...
欢迎关注天下博客:http://blog.genesino.com/2018/03/chip-pipeline/前年在中科院做培训时,整理了一套ChIP-seq分析流程,截选...
安装包 查看rvest包的详细信息 包的用法: read_html() 读取html文档的函数,其输入可以是线上的url,也可以是本地的html文件,甚至是包含html的字符...