作为模式生物，拟南芥（Arabidopsisthaliana）主要有以下几方面的优势： 第一，拟南芥的基因组在常见的植物模型中是最小的，染色体数目也很少，只有五对同源染色...
IP属地：山东
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从拟南芥的T0123代获得纯合株系，转基因必经之路！ -
基础知识 — Exons,Introns,ORF,CDS,UTR,lncRNA,转录本,可变剪切,密码子,启动子,顺式调控元件,转录起始位点,终止子,转录因子,结构基因1.核酸，基因，DNA，染色体，基因组，同源染色体，等位基因 核酸，基因，DNA，染色体 核酸：一种通常位于细胞核内的大型生物分子，主要负责生物体遗传信息的携带和传递。核酸有...
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图解：如何在NCBI上找到具体一个基因第N个外显子的序列,以EML4基因为例一个基因包括外显子和内含子部分，有时候我们需要了解基因包含的具体外显子位置信息。确定的方法有很多种，比如NCBI、USUC和Blast等。这里我们用NCBI的方法找到一个基因...
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【现学现卖】用更少的克隆得到更长的序列
最快得到几乎是全长的微生物序列的方法是深度测序，比如之前的这篇文章【现学现卖】链霉菌的全基因组分析（2）。 那如果不是深度测序，想要得到微生物的全长序列，比如真菌中的病毒为例...
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批量提取某通路基因并用于下游分析前言：实验中往往比较关注某一信号通路基因的表达变化，而通过文献检索或利用转录组测序结果筛选，往往信息不全，缺乏系统性，如何提取出重点关注的信号通路上所有基因的序列，并进行下游...
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GO注释和富集分析概念介绍
什么是富集分析？ 当我们获得了一批生物数据时，例如转录组的数据，蛋白质组的数据，其中必然要做不同样本之间的差异基因分析这一步，例如空白对照组与实验组的差异基因或蛋白分析。在得...
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TBtools进行GO富集分析1、下载GOA文件，下载网址如下：http://current.geneontology.org/annotations/index.html[http://current....
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个人向ggplot2箱线图总结主要从如何看图、用图与作图三个方面来对箱线图进行理解和总结。 1、看图 如图所示，箱线图是将一组数据按照大小顺序排列后进行绘制的，包含6个数据节点，分别表示出数据的上边缘、上...
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生信软件：Blast（本地）
转载自：http://08643.cn/p/a912ad4a8dee有部分改动 Blast，全称Basic Local Alignment Search To...
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2?? 双序列比对(2)：BLAST详细操作:web版和linux版序列比对和序列特征分析总目录 网址：https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi运行方式：本地或web 基本的BLAST工具包括： bla...
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简洁 | 优雅地整理 BLAST 比对结果写在前面 用过 BLAST 进行基因功能注释的朋友应该常常遇到两个问题： BLAST 输出格式较多，选择哪一类输出格式更为实用？ 输出结果信息较多，如果方便下游数据分析？ B...
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比对-NCBI blastBLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库...
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如何利用NCBI预测基因的结构域和保守位点1. 使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。具体我们可以进入NCBI后选择Conserved Domain然后...
