关于单细胞转录组转录因子的分析我们之前在单细胞系列讲过R语言版本的，参考：跟着Cell学单细胞转录组分析(十二):转录组因子分析[http://mp.weixin.qq.co...
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PySCENIC（一）：python版单细胞转录组转录因子分析
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R语言|Cox模型校准度曲线绘制转自个人微信公粽号【易学统计】的统计学习笔记：R语言实现Cox模型校准度曲线绘制[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU4MjgyODQzN...
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单细胞交响乐17-不同单细胞R包的数据格式相互转换刘小泽写于2020.7.18为何取名叫“交响乐”？因为单细胞分析就像一个大乐团，需要各个流程的协同配合单细胞交响乐1-常用的数据结构SingleCellExperiment单...
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单细胞之富集分析-2：批量GSEA和GSVA分析单细胞富集分析系列： 单细胞之富集分析-1：单细胞GSEA分析流程[http://08643.cn/p/00f069cb239c] 1. 背景 Gene Se...
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67-R中dataframe与list的转换
内容概览 1、dataframe转换为list-- 1.1. 每一列作为list的一个元素-- 1.2. 每一行作为list的一个元素-- 1.3. 对行进行分组，每一组作为...
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安装ComplexHeatmap报错，cairo安装问题ComplexHeatmap安装了之后，加载一直报错，报错信息如下： 看样子是Cairo 没有加载上尝试安装加载 安装正常，还是加载报错 首先百度各种消息唯一可能有效的是简书...
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纤维化机制：Myofibroblast的来源和功能1. 简介 纤维化是由肌成纤维细胞在慢性炎症反应中过度沉积细胞外基质（ECM）蛋白引起的疤痕和组织硬化。多种有害刺激（包括毒素、传染性病原体、自身免疫反应和机械应激）能够诱导...
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TCGA文章复现——LncRNA-CRC预后Title:An Integrated Three-Long Non-coding RNA Signature Predicts Prognosis in Colorecta...
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TCGA数据的一致性聚类实战和可视化通过不同的聚类算法，依据不同的基因或指标给样本聚类，是数据挖掘文章里面经常出现的操作咯。接下来要写写不同聚类方法的介绍和代码实现啦。 1.输入数据 目前从网上找到的代码大多是...
