发简信
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系统发育关系:系统误差
随机误差随着数据量增加而减少，系统误差随着数据量增大而增大。常见的系统误差包括三种:第一种是序列组成异质性(compositional heterogeneity)第二种是速...
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DNA 中的 3' 端、 5' 端是什么意思？
DNA的结构由磷酸集团、五碳糖和碱基构成。 根据化学对碳原子顺序命名，从五碳糖离氧原子最近的右侧第1个碳原子开始标号，依次对碳从一标到五，我们可以发现，在5号碳原子上可以连接...
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同问，同学你解决了吗 我调整了参数依旧不成环
七. 植物叶绿体基因组--组装，注释和比较作图（GetOrganelle，GeSeq，Chloroplot，IRscope）
一. 简介 叶绿体是绿色植物，藻类和蓝细菌进行光合作用的场所，光合作用将水和二氧化碳转变为有机化合物并放出氧气。叶绿体所携带遗传物质DNA，以原核细胞的编码方式转录合成一些自...
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还是fasta文件
叶绿体基因组组装软件NOVOPlasty使用简介
NOVOPlasty 是一个perl脚本，没有依赖任何其他软件，下载好以后直接可以使用。下载链接https://github.com/ndierckx/NOVOPlasty ...
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老师 想请问一下我的这个生成3个option文件 这个有问题吗 后面需要怎么处理呢
叶绿体基因组组装软件NOVOPlasty使用简介
NOVOPlasty 是一个perl脚本，没有依赖任何其他软件，下载好以后直接可以使用。下载链接https://github.com/ndierckx/NOVOPlasty ...
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不用安装 直接解压就可以
叶绿体基因组组装软件NOVOPlasty使用简介
NOVOPlasty 是一个perl脚本，没有依赖任何其他软件，下载好以后直接可以使用。下载链接https://github.com/ndierckx/NOVOPlasty ...
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跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2画世界地图的简单小例子论文是 Whole-genome resequencing of 445 Lactuca accessions reveals the domestication histo...
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illumina测序原理hello，大家在疫情期间都是怎样度过的呢？今天我利用一点时间，我们回顾illimina测序原理，非常值得从事生物学研究生的小白查阅哦~ 我的主要参考资料是如下的两个非常重...
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一个神奇的存在---B染色体研究团队利用染色体分选、Illumina测序、Bionano光学图谱、Hi-C等方法相结合组装出328个B染色体特异的scaffolds，总长度125.9 Mb（和其它基因组...
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不需要 是的上传的序列都会让填feature，注明是什么序列
将叶绿体基因组上传至NCBI
目的 将公司测序并筛选得到的叶绿体基因组上传至NCBI 方法 使用getorganelle,blastn,cpgavvs2,mpi,mega等一系列软件完成有关文件的准备。 ...
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R语言配色方案——RColorBrewer包
R语言配色方案——RColorBrewer包 安装并加载 四大函数功能 1、首先运行下第一个函数 该函数运行的结果是查看所有可选调色板的列表。这里调色板很多我用head()只...
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您好 我想问下我的结果下载不了 您有遇到这种情况吗
REPuter注释叶绿体重复序列
REPuter可注释叶绿体重复序列，包括4种类型，Forward（F）, Reverse (R), Complement (C), Palindromic (P)。 REPu...
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我的VISTA Browser也打不开
学习小组----mVISTA使用2
使用中的几点心得：1、除了在线版的，我们还可以在网站上填写信息申请离线的软件。但我试用了一下，需要先自己比对，然后要按照一定的格式来制作文件，当然你还必须得安装java才能运...
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我直接在geneious一个一个看的?? 另外想问 看各分区分别的基因数量 这个可以用什么实现呢
计算叶绿体基因组LSC/IR/SSC的GC含量
我这里使用python和biopython，关于python和Biopython的安装可以参考我的B站视频 https://www.bilibili.com/video/BV...
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@小不点打羽毛球 好的好的 谢谢
mVISTA格式文件：由Perl脚本处理GenBank注释文件而来
Bioinformatic_Scripts/get_mVISTA_format_from_GenBank_annotation 1、简要说明 mVISTA是常用的叶绿体基因组...
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我是看的参考文献 大部分都是用的3
使用REPuter遇到的小问题
叶绿体基因组的文章通常都会做重复序列分析，其中会使用在线工具REPuter https://bibiserv.cebitec.uni-bielefeld.de/repute...
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您好 想请问下 在运行结束后出现”Use of uninitialized value $TYPE1{"86"}“，这个有什么影响吗 搜了一圈感觉不是太懂
mVISTA格式文件：由Perl脚本处理GenBank注释文件而来
Bioinformatic_Scripts/get_mVISTA_format_from_GenBank_annotation 1、简要说明 mVISTA是常用的叶绿体基因组...
