大家好,今天小编分享一个亲测给力的生物信息学新工具——LexicMap。 ??LexicMap是一个核苷酸序列比对工具,专为高效查询基因、质粒、病毒或长读长序列设计,能够应对高...
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GPU工具分类 实话实说,暂时只有英伟达的GPU才能实现比较方便的基因组分析集成化解决方案,其他卡还需要努力呀,或者需要商业公司或学术团体的努力开发呀!FPGA等这种专用卡的...
分别是中国人群和东北亚人群的填充参考,测试了下,中国人群的参考注册还是相对友好的,没有像有些网站一样严格限制。东北亚的没有测试,两个数据库的特点都是包含了少数民族,研究朝鲜或...
最近学习祖源分析方面的内容,发现已经有了GPU版的软件,可以几十倍地加快运算速度,推荐使用!小数据集的话家用显卡即可hold住,十分给力!ADMIXTURE 是常用的群体遗传...
最近在qiime2论坛发现有人发布了qiime2宏基因组的教程,这里分享一下,只是alpha版本,不成熟,大家谨慎了解。qiime2的专用格式对于折腾宏基因组还是有点不妥的,...
feast团队的小幅更新之作,比较可惜的是由于发表的杂志影响不大,迄今引用只有个位数,相信这好酒香一定会飘出深巷子的。微生物源追踪分析已成为一种广泛的技术,用于表征复杂微生物...
笔记本型号是Redmi G2021,配置还凑活,5800H,16G, 3050Ti Laptop(4G VRAM),相当一般的配置啦!不过自从英伟达更新了驱动,可以实现RAM...
mummer2circos 是一个用于绘制细菌基因组的圈图(circos图)的工具。它基于 BLAST 或 NUCMER/PROMER 的比对结果,生成 SVG 和 PNG ...
今年 12 月,QIIME 2 团队选择放弃计划的 2023.11 版本,转而减少拉取请求的长队列并开发一些新功能。 有关 2024.2 中计划中的向后不兼容接口更改的完整详...
记得宏基因组公号的刘博一直主推使用Rstudio+Git for windows来进行windows下的命令运行和数据分析,我也发现这个方法挺棒的。好处是每个命令直接就运行了...
小编欢乐豆又放出一个珍藏多年的脚本,2749行的长度,长到已经难以用GPT解读啦,不过用起来还是很方便的!这个perl脚本用于将GenBank格式的文件转换为GFF3格式。 ...
可以的,我不是大佬,愿意帮忙的,免费的
如何从安卓手机中恢复Google Authenticator的密钥从Android设备恢复Google身份验证器密钥以进行备份 (github.com)[https://gist.github.com/jbinto/8876658?perm...
从Android设备恢复Google身份验证器密钥以进行备份 (github.com)[https://gist.github.com/jbinto/8876658?perm...
qiime2有自带的差异分析工具的(composition ancom),可是,大家已经习惯了一直用的lefse,于是,把qiime2的结果导出进行lefse分析,在某种程度...