说到deeptools，[https://www.baidu.com/link?url=6F9PeldteljlCkBMSOkg1_W9oDlmyJQvYqxFSPXmN5h...
发简信
IP属地：广东
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deeptools？还可以这么用！ -
nPerm = x，数字调大
关于GSEA富集结果条目数一跑一变的迷思和恍然大悟
当只有自己发生状况时，归结给运气和自己太菜；当别人发生同样的状况时，归结给共同的客观原因，比如网速太慢、电脑太烂；当伟大的互联网告诉你有更多的人遭遇了同样的困惑，才终于投向科...
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没用过GSEA软件，R里面可以用fgsea这个包，至于得到的结果是不是像clusterProfiler这样每次都不一样，我也不清楚...clusterProfiler似乎是调用了fgsea，这两个应该是一样的
关于GSEA富集结果条目数一跑一变的迷思和恍然大悟
当只有自己发生状况时，归结给运气和自己太菜；当别人发生同样的状况时，归结给共同的客观原因，比如网速太慢、电脑太烂；当伟大的互联网告诉你有更多的人遭遇了同样的困惑，才终于投向科...
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我自己写的，没发布，没有网址
基于神包clusterProfiler的ID转换+MSigDb+KEGG分析的shiny小工具
啥也不懂，啥也不问 就放个ui代码吧 用DOSE的内置数据写出为.txt后重新读入 点一下 但发现一个问题： 设置图片储存路径后，*.pathview.png还是在工作路径中...
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SSH 远程登录 WSL饱受 Teamviewer/向日葵 之苦后，还是决定操作一番 安装 openssh-server 修改 sshd_config 文件 PasswordAuthenticati...
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bedtools shuffle 迷思bedtools shuffle 的目的是保持每个 interval 的总长，随机变换所有 inerval 的位置，结果可以作为一种随机背景。-chrom 参数将随机重分配限...
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使用 Python 把多个 MP4 合成一个视频
这两天群里有个小伙伴有一个需求, 就是把很多个视频文件 合并成一个. 期间也找了各种软件, 如格式工厂, 但是只能一次合成50个文件, 小伙伴有几千个文件需要合成, 太繁琐;...
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rawdata 有数字的部分提取出来，转换成matirx
菜??日记-转录组edgeR分析差异基因及案例演示
菜??的第一次正式上手R，相当于翻译了 edgeR 这个包的 UserGuide，跑了第一个 case眼看写了这么多字，还是发一下比较好，万一有人看呢 edgeR简介 edge...
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@要快乐_更要经历山河 不一定噢，看看你的序列的 object 性质
biomaRt: 用R愉快检索BioMart数据库
网速慢的原因找到了 R 与 BioMart 数据库的语言接口 (interface) Durinck S, Spellman P, Birney E, Huber W (20...
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@腻歪_0bb5 当时应该是3.6或3.7，不是很老的版本应该都可以把
不出Rstudio, 实现从多序列比对到画进化树
本文是对前几天的打脸打脸之处就在于发现了muscle的R包，从此不用再为序列比对东奔西跑—— Step 1. 从基因名拿到序列 这一步用到的包：biomaRt ，选择用sym...
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@bluebluesk_0288 这个....没有前因后果单这一句报错我是看不出问题所在的...
R包安利 ① easyPubMed—PubMed利器
想让这张图当封面 1.1 关于 easyPubMed 作者是 Damiano Fantini ，2019-03-29 发表，甩链接。 看它的 Title: 搜索和读取 Pub...
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都写了是权限问题.....后发现win 10 ubuntu子系统有特殊的文件访问方法
当 Salmon 构建 index 秒失败时应该反思哪里
操作环境：Win10 Ubuntu子系统 1. 下载参考转录组 下载传送门：http://ftp.ensembl.org/pub/release-76/fasta/homo_...
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函数参数里可以选的（印象中
不出Rstudio, 实现从多序列比对到画进化树
本文是对前几天的打脸打脸之处就在于发现了muscle的R包，从此不用再为序列比对东奔西跑—— Step 1. 从基因名拿到序列 这一步用到的包：biomaRt ，选择用sym...
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ConsensusClusterPlus 所有图会出现在工作路径的文件夹里
ConsensusClusterPlus: R中实现鉴定簇集数及其成员的算法
无监督分析下鉴定簇集数及成员 Wilkerson, D. M, Hayes, Neil D (2010). “ConsensusClusterPlus: a class di...
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哈哈哈哈哪个坑，我忘了已经
biomaRt: 用R愉快检索BioMart数据库
网速慢的原因找到了 R 与 BioMart 数据库的语言接口 (interface) Durinck S, Spellman P, Birney E, Huber W (20...
