最近一段时间正在努力学习单细胞相关的理论知识，发现单细胞测序和普通的真核细胞的转录组非常相似。两者之间的最大的区别在于，一个测的是单个细胞的表达，一个测的是一堆细胞的表达之和...
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如何简单快捷的进行单细胞分析 -
零代码学生信第十一天-临床特征的比较生信套路分析的文章中临床表型的比较往往用来进一步衬托基于特征基因构建的分子亚型或者是风险模型，更具有临床意义，而这里的临床意义更多的指的是，预后价值和诊断价值。 这里给大家介...
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零代码复现5-CAF细胞的套路文章原文链接： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9537943/ 背景： 癌症相关成纤维细胞 （CAF） 参与肿瘤生长、...
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零代码学生信第十天-差异基因的富集分析在上一节我们介绍了如何做差异法分析，通过差异分析可以了解在不同处理组存在哪些差异基因，接下来，我们需要对了解这些差异基因参与哪些生物学过程，有哪些生物功能，这时候需要对差异基...
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零代码学生信第九天-差异分析的可视化有哪些？前面学习怎么做差异分析，差异分析的R包是需要根据数据进行选择的，前面我们提到了芯片数据一般用limma包做差异，高通量的二代测序如果是count数据（全是整数），可以选择使用...
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零代码学生信第八天-什么是差异分析？怎么做差异分析？提到差异分析，大家都不陌生，什么是差异分析呢？差异分析的目的是为了什么呢？怎么做差异分析呢？ 首先差异分析是什么？ 差异分析又可以被称为差距分析，主要就是为了查看两组之间影响...
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零代码复现3-肝细胞癌Anoikis相关亚群的鉴定及预后模型网址：http://www.sxdyc.com/zeroCodeTool 文章解读的链接：https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkxMjMxO...
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零代码复现2-基于TGF-β个性化纯生信套路经过团队内部加班加点，终于零代码复现2与大家见面了，零代码2的分析，更侧重于某一个特定的功能集，进行直接建模，这个功能集可以从文献中挖掘，KEGG 的通路，疾病的相关功能，单...
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零代码复现1-BNIP3作为识别实体瘤预后和诊断的潜在生物标志物本文复现的是一篇单基因泛癌的文章，原文链接： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10466744/ 本文分析并不难，主...
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零代码学生信第六天-怎么构建风险模型（二）目前101算法组合用来构建风险模型的文章越来越多了，那么这种分析怎么做的呢？ http://www.sxdyc.com/prognosticmodel 需要上传四个文件 第一...
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零代码学生信第五天-怎么构建风险模型（一）NCBI一搜肿瘤的分析风险模型作为不可或缺的一部分，几乎是每一篇生信文章必不可少的部分，那么我们到底怎么理解模型呢？ 准确来说，模型分两种，一种是诊断模型，一种是预后模型，我...
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零代码学生信第四天-单/多变量cox分析在肿瘤数据挖掘中，单变量cox分析（单因素cox分析）和多变量cox分析（多因素cox分析）是非常重要的一个环节。他们的目的到底是什么了，之前看到他们在答疑群中经常群主会回复...
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零代码学生信第三天-什么是TIDE？作为一个肿瘤科的小主治来说，数据挖掘是一个不错的选择，在看了很多文章后，我发现，基本上所有的肿瘤生信文章中，不可避免的都有免疫分析，在分析的过程中，会将样本进行分组，预后差的...
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零代码学生信第二天-TIP是什么？在免疫分析中，生信豆芽菜提供了一个TIP预测免疫 TIP预测免疫 - 生信豆芽菜 - 专门做分析的生信平台. (sxdyc.com) 他的操作其实很简单，就是上传一个表达谱数...
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零代码学生信第一天-如何进行免疫浸润分析作为一个底层打工人，一边搞临床，一边学生信，真的很崩溃。最近发现零代码学生信对于我们这样的医学生来说实在是太友好了，为此，我把每天学习的心得写下来，也算一场美好的记录吧！ 免...