本文是百迈客GWAS生物信息培训课程学习笔记第二篇，第一篇请参考GWAS基本分析内容 这里首先介绍了GWAS分析中常用的统计学概念： 1. 假设检验 零假设(H0,null ...
发简信
IP属地：江苏
-
常用GWAS统计方法和模型简介 -
TiED:人类组织特异性增强子数据库
欢迎关注”生信修炼手册”! TiED是一个人类增强子数据库，对10种不同组织中的增强子表进行定量和分析，鉴定了增强子的组织特异性，网址如下 http://lcbb.swjtu...
-
Juicer:Hi-C数据处理分析（一）参考： [1]. Durand, N.C., et al., Juicer Provides a One-Click System for Analyzing Loop...
-
R小tip（六）ggplot2拼图这次我们简单介绍先ggplot2的拼图方法，推荐patchwork这个包，语法简单，好用，接下来我们通过个例子来向大家讲述： 其中加是横着拼图那么竖着拼图用除号 其中 （ |...
-
聚类分析（Cluster Analysis）（一）什么是聚类 聚类，将相似的事物聚集在一起，将不相似的事物划分到不同的类别的过程。是将复杂数据简化为少数类别的一种手段。 （二）聚类的基本思想： 有大量的样本。 假定研究...
-
基因组注释文件(GFF,GTF)下载的四种方法
NCBI Ncbi 里包含现在最全的参考基因组数据，可以进入FTP站点查看：ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/ 这里的文件夹名为物种的拉丁...
-
ChIP-Seq数据挖掘系列-2: Motif 分析(2) - HOMER Motif 分析基本步骤在基因组调控元件分析中，HOMER 可以用于发现新的motif。HOMER 通过比较两个序列集，再使用ZOOPS scoring (zero or one occurrenc...
