LD衰减距离指的是，当平均LD系数衰减到一定大小(最大值的一半/0.5以下）的时候，对应的物理距离。通常用LD衰减距离来描述LD衰减速度。LD衰减速度越快，即衰减距离越小，说...
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StringTie + DESeq2 进行 RNA-seq 差异基因分析按：RNA-seq 流程非常多样化，每一个步骤可选工具都非常多。我的选择是 StringTie 进行组装取得 read counts 数值，DESeq2 分析差异基因。这里把...
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BSA分析（六）——QTLseqr包前言 我在犹豫是否补充一篇怎样拆分染色体进行比对和变异检测（主要是为了提高比对和变异检测效率）的帖子?？济挥泄婊馄谌莸脑蛴辛降悖阂皇悄谌荼冉霞虻?，觉得可能用处不大；二...
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以水稻为例教你如何使用BSA方法进行遗传定位（下篇）接着上一篇留下的问题，如何按照以1M为窗口，每次移动10Kb计算均值。我们以KY131是"0/0", 而 "DN422" 是 "1/1"的位点结果为例，我们来增加这条线 原...
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杂交群体交换单株筛选方法在使用杂交群体定位QTL的过程中，交换单株的选择是至关重要的。 首先需要明白什么是交换单株。父本植物（基因型为AA）与母本植物（基因型为BB）杂交，得到的F1代含有来自A与B...
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Venn图难以展示大于5组的集合怎么办？用UpSet图表示Venn图经常用于表现组间重叠元素的数量信息。但是随着分组数量的增多，Venn图的结构会越渐复杂，如下所示，当分组数量为5组时，已经不容易从中识别交集概况了。因此，这也是为什...
