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发简信
IP属地：香港
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单细胞转录组学分析确定了人类个体发育过程中红细胞前体中的免疫倾向群体Single-cell transcriptomic analysis identifies an immune-prone population in erythroid ...
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@BINBINCC 您好您好，就是您列出来的这种，比如说有黄色警告，写着low Fraction Reads in Cells这种，细胞捕获数量大致在2000-3000，中位数大致是1000左右。
Cellranger count 中网页结果说明
在cellrangercount运行结束后，outs文件夹中会有一个名为：web_summary.html的网页文件，可通过浏览器直观的查看测序数据的质量如何，一起看看吧！ ...
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但就是我想问下这种数据能使用吗
Cellranger count 中网页结果说明
在cellrangercount运行结束后，outs文件夹中会有一个名为：web_summary.html的网页文件，可通过浏览器直观的查看测序数据的质量如何，一起看看吧！ ...
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你好，我想请教一下。我想做的是草鱼的重复序列注释，repeat families这里输入teleost说是“Ambiguous search term 'Teleost' (found 5 results, 0 exact).Please use a more specific name or taxa ID, which can be looked up with the 'names' command.” 还是说我直接用斑马鱼去做近源物种？
非模式生物重复序列注释 RepeatModeler2+RepeatMasker4
首先安装RepeatModeler2,RepeatMasker4建议直接去官网下载，解压安装。同时安装其他包。安装流程这里不详细介绍了，网上有很多。 假设现在已经安装完毕，并...
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OrthoFinder 进行直系同源基因分析教程
介绍 OrthoFinder 是一个快速、准确和全面的比较基因组学平台。 它找到正交群(orthogroups)和直系同源(orthologs)，推断所有正交群的有根基因树，...
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@归疚_7d96 看你最后目的是想干啥吧，比如你想通过找单拷贝直系同源基因然后建树的话可以尝试用线粒体试一下。或者降低覆盖度，用低拷贝。
跨物种直系同源基因比对
这里还是以草鱼和人类比较 1. Orthofinder 是看了一篇2021在NC上发表的11个非模式物种单细胞图谱，其中涉及到跨物种的一个比对方法。 Orthofinder使...
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这个我也不是很清楚，其实我做的鱼和人的，按理来说物种差异也挺大的，但同源基因有1w多一点。不知道你的物种是什么
跨物种直系同源基因比对
这里还是以草鱼和人类比较 1. Orthofinder 是看了一篇2021在NC上发表的11个非模式物种单细胞图谱，其中涉及到跨物种的一个比对方法。 Orthofinder使...
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【单细胞转录组】人类B细胞亚群分析Marker基因汇总由于基因表达跟细胞表面蛋白的表达具有时间差，所以要根据经验具体情况具体分析，内容仅供参考 ??哺乳类动物B细胞的分化过程主要可分为前B细胞、不成熟B细胞、 成熟B细胞、活化B...
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请问一下你找到解决方法了吗
cellranger使用前数据准备
一般来说，我拿到的测序公司给我交付的数据是可以直接作为cellranger的input的。 但是也存在命名不规范，报错的情况，所以自己需要手动的修改文件的名称，查资料需要修改...
