安装https://github.com/aljpetri/isONform?tab=readme-ov-file[https://github.com/aljpetri/i...
安装https://github.com/aljpetri/isONform?tab=readme-ov-file[https://github.com/aljpetri/i...
需要在linux系统中,要装了seqkit软件 使用例子 提取指定物种MLA的全部收缩扩张基因和显著收缩扩张基因,分别在两个子文件夹中,--column要输入该物种在Orth...
根据编号修改fasta序列名 读取rename_list.txt文件,有两列,第一列是编号,第二列待改的名字,该文件开头内容如下:L019 L019_Scutellar...
直接用apt安装的R版本只有3.6,有部分R包不能使用.在网上找了一圈教程,发现都成功,最后在清华源的CRAN官网上终于找到可靠的方法:https://mirrors.tun...
三个以上基因组的话的有一个选项,可以进入另一个界面
跟着Nature Communications学作图:synvisio在线工具展示MCScanX共线性分析的结果synvisio在线工具 链接 https://synvisio.github.io/[https://synvisio.github.io/]之前知道这个工具,但是没有搞懂...
依赖biopyhon包pip install biopython 首先获得当前基因组文件的序列名,以便后续编辑。注意,生成的list.txt文件原编辑为等下提到的三列格式。s...
需要安装biopythonpip install python --chr输入同向替换的序列名--rev输入反向互补然后替换的序列名多个序列用逗号分隔 你可以使用以下命令行指...
蛋白质25%有点太低了吧,而且蛋白质应该比核酸变化更慢啊,怎么会标准比核酸低那么多
sequence identity 和 sequence similarity⑴序列一致性或同一性(sequence identity) :两条序列在同一位点上的核苷酸或氨基酸残基完全相同。The extent to which two (nucleo...
使用conda安装,使用过程中报错查阅得知是diamond的版本不兼容导致将diamond降级后问题解决conda install -c bioconda diamond=0...
博主好install.packages(UpSetR)这里漏了引号,install.packages(“UpSetR“)
UpSetR:集合可视化神包对于集合的可视化,第一时间想到的都是韦恩图(venn diagram),一般集合不超过5个的时候,可视化效果还是不错的 但是一旦数据集增加,比如说五个的时候,你就很难从图中解...
使用官方推荐的安装命令 产生如下奇怪的glibc冲突 可是明明2.31大于2.17版本啊,经过查阅,发现可能是conda同时搜索conda-forge和default库产生冲...
@王梓维 这里要清晰的是软件目录下所有perl脚本(.pl结尾)都要改
安装GeneMark-ET遇到的错误在安装GeneMark-ET软件时:一直卡在以下错误中 Can't locate Hash/Merge.pm in @INC (you may need to install...
个人感觉EDTA是目前注释转座子最好的软件之一了,使用docker可以很方便地使用而且这个docker容器还集成了repeatmasker和repeatmodeler,可以省...
一、下载数据 GSE111229 :https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE111229[https://...