Cellphonedb 安装记录（Linux） 1.首先在conda base环境中安装R:conda install R(mamba install R); 2.然后创建c...
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2022-03-26 -
GEO数据分析中exprs提取表达矩阵，pData提取临床信息
关于用getGEO下载数据后，会得到一个list，取出第一个列表中的元素后，再查看这第一个元素的数据类型后，发现他是一个对象（"ExpressionSet"），然后我们就会用...
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Seurat的打分函数AddMouduleScore在读张泽民老师发表的新冠文献的时候看到计算免疫细胞的cytokine score或inflammatory score使用了Seurat包的AddMouduleScore函数...
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单细胞实战2: Seurat+SingleR--从矩阵到细胞类型注释单细胞数据标准分析Seurat流程： Seurat官网：https://satijalab.org/seurat/articles/get_started.html[http...
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10x Genomics RNA-seq 原理详解近期的一系列际遇都再次论证了我真的是一个靠运气闯荡江湖的人，鬼使神差的混入了一个超棒的实验室，并且受到了同伴和室友在工作和生活上的无私的照顾。日子像梦一样美好，我只想时间走的...
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CellChat：细胞间相互作用分析利器前言 我们知道，细胞间信息传递方式一个是细胞表面配受体的相互作用，另一个通过细胞产生的可溶性小分子，即细胞因子。在单细胞数据分析中下游，有时候我们想看某几种细胞类型之间的相互...
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该画上句号了，感恩！
这个号以后不会更生信学习的内容了。如果顺利的话，年底毕业，我去工作了。下面的话，来自我的毕业论文，想贴出来，在我的博客里面，感谢大家的帮助，感恩遇见，感恩这段岁月。 时光荏苒...
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单细胞测序（scRNA-seq）通关||数据处理必知必会单细胞转录组数据分析系列教程 sc-RAN-seq 数据分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jians...
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