1. 下载Cisbp数据库中的motif文件 (1) 下载文件 CISBP数据库[http://cisbp2.ccbr.utoronto.ca]...
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如何从CisBP数据库生成ArchR使用的Motif PWM文件 -
单细胞拟时序分析1-基因及通路随拟时表达变化趋势单细胞拟时分析：基因及通路随拟时表达变化趋势 - 简书 (jianshu.com)[http://08643.cn/p/ff44...
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单细胞拟时分析：基因及通路随拟时表达变化趋势
之前给小伙伴做分析复现的时候，接触到一篇Cell文章的拟时分析，参考文献：Single-cell landscape of the ecosys...
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Seurat v4 与 v5 数据整合工作流的技术差异说明批次效应 是指在实验中由于不同的实验条件、操作人员、试剂批次、设备差异等非生物学因素引起的系统性差异。具体来说，在单细胞RNA测序（scRNA-...
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课前准备-分析来自癌症空间转录组的未映射RNA-seq数据以破译癌症微生物组作者，Evil Genius 最近的研究越来越强调微生物组在癌症发生和发展中的重要性。因此，探索微生物组在肿瘤微环境中的调节作用，了解其组成和功...
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课前准备--单细胞突变矩阵的获得与有害位点的识别作者，Evil Genius 22号马上上课了，该准备的基本都准备完毕，静待上课就可以了。当然期间还会根据情况进行更新 单细胞测序数据生成的ba...
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sceasy和 CELLxGENE
sceasy sceasy 是一个帮助不同单细胞数据格式间相互转换的包。转换为 AnnData 格式后，可以直接在 cellxgene[http...
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10X单细胞数据整合分析Seurat之rpca（large data，细胞量超过20万）不知道大家在研究单细胞数据整合函数FindIntegrationAnchors[https://satijalab.org/seurat/ref...
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单细胞多样本整合之CCA(Seuratv5)前言 看到一篇单细胞数据挖掘的文章，题为：Establishment of a Prognostic Model of Lung Adenoca...
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