『鹅厂号: 生信云笔记』分享生信分析及数据可视化相关的内容，欢迎关注和交流！<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2F1156054203.github.io" target="_blank">https://1156054203.github.io</a>
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RNA-seq入门实战（八）：GSVA——基因集变异分析本节概览：1.GSVA简单介绍2.基因集的下载读取: 手动与msigdbr包下载3.GSVA的运行4.limma差异分析5.GSVA结果可视化：热图、火山图、发散条形图/柱形...
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解决报错ImportError: cannot import name 'GC' from 'Bio.SeqUtils'
简单记录.在安装软件的时候遇到ImportError，?？檎也坏?在我的情况中是因为biopython的版本问题. 所以，降低biopython版本 然后就看起来正常工作了!!
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使用R web框架Shiny轻松构建生信交互式网站做生信需要懂 R web框架 Shiny吗？答案：不懂R Shiny的生信科研工作者不是好生信科研者 说说这几年我用web框架参与构建生信网站的项目（就是我搬的砖），1.某病...
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【单细胞测序数据分析-1】认识Seurat对象数据结构/数据格式及操作一文了解单细胞对象数据结构/数据格式，单细胞数据操作不迷茫。本文内容包括 单细胞seurat对象数据结构， 内容构成，对象的调用、操作，常见函数的应用等。 1. 单细胞seu...
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基于Seurat结果推断单细胞群肿瘤纯度之ESTIMATEInferring tumour purity and stromal and immune cell admixture from expression data.，NC,...
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单细胞数据处理小细节汇总1. Seurat对象查看当前的Assay 在进行了SCTransform操作后，矩阵默认会变成SCT矩阵，如果不加设置，后续的PCA等操作都是基于SCT矩阵。修改Defau...
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Seurat的打分函数AddMouduleScore在读张泽民老师发表的新冠文献的时候看到计算免疫细胞的cytokine score或inflammatory score使用了Seurat包的AddMouduleScore函数...
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clustree报错
报错信息：Error in check.length(gparname) : 'gpar' element 'lwd' must not be length 0解决办法：更新...
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感谢楼主的教程，安装完成?。“沧肮讨杏龅絪h mysql.server start 报错：my_print_defaults: Can't read dir of '/etc/my.cnf.d' 通过 mkdir /etc/my.cnf.d 解决。参考https://blog.csdn.net/u011250186/article/details/109196145
Linux在线安装mysql5.7到指定目录
目标： 1.自定义mysql安装目录2.自定义mysql数据目录3.正确安装并启动mysql4.输入密码正确登录 说明：本文mysql下载目录 /usr/download本文...
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单/多个基因在组间同时展示的多种选择：分组小提琴图、分组/分面柱状图、单基因蜂群点图拼图绘制这是ggplot2可视化专题的第二个实例操作 【ggplot2的基本思路见前文总论】：基于ggplot2的RNA-seq转录组可视化：总述和分文目录 【ggplot2绘图具体...
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小技巧2-melt()函数转换(R)我们常见的数据一般长这样： 作图时常用的形式是这样：（这个就是melt型数据） 图片来源：[pandas]处理pcr数据的时候，melt真是好东西呀 - 路人乙小明的文章 -...
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Python编程快速上手 让繁琐工作自动化PDF版带源码
如今，人们面临的大多数任务都可以通过编写计算机软件来完成。Python是一种解释型、面向对象、动态数据类型的高级程序设计语言。通过Python编程，我们能够解决现实生活中的很...
