生信log14|生信自学不求人-靠谱学习资料总结和评价

生信学习资料

自学生信不求人,现在网上资料越来越丰富,但是资料多也意味着鱼龙混杂,并且让人无从选择。正确做法应该是,找一个适合自己且完善靠谱的学习资料,从头到尾跟一遍,代码敲一遍&一遍^n 次,这里精选了一些课程供大家参考(部分收费,按需自取,想白嫖的白嫖,想给作者恰饭的给作者恰饭),这里推荐作者自己踩过坑(学过),并且觉得还不错的资料,也给自己梳理一下资料。

这部分的资料不一定适合所有人,资料不在多在于精。这份资料更加倾向于推荐给生信使用者,生信业余爱好者以及要转行生信的同志们,若要深入了解生信那么还有很多基础需要补充如数学,计算机等理论实战知识。

为什么要学生信

  • 大数据时代的潮流席卷每一个学科,自基因组测序成本下来后,每个实验室难免都会去测一下物种的基因组尤其是微生物的,技术的发展必然带来数据的膨胀,测序拿到的结果都有很多文件,很多文本数字信息,重复劳动 + 统计学分析,不学点生信怎么够时间完成科研KPI(一些有经费的课题组可以外包业务,但是课题组经费有限老板的就不一定愿意每个样品加钱去买数据分析的服务了);
  • 为了更好地与技术人员沟通,即使自己真的不需要动手做生信的数据分析,也要具备理解数据和与技术人员沟通的能力,知道数据的处理是否合理(统计学合理,生物学意义解释得通,能解决科学问题

理论部分

实操视频课推荐(实际上都是理论实践相结合的)

公众号

  • 生信菜鸟团:有很多数据处理的小技巧;
  • 宏基因组:偏向环境微生物,人体微生物方向;
  • 基因学苑: 偏重微生物组数据分析;
  • biobabble:Y叔大名必须晓,专注于写R包可视化以及R的数据处理。
  • 生信技能树:癌症分析,医学生信分析都可,就是真核的基因组。
    PS:上述的这些公众号均有各种语言基础,如linux,R,Python等等,而且也会吐槽一些离谱的数据分析论文,以助大家理性看待现存的SCI

书籍

  • biostar handbook!强烈推荐没有之一,理论与实际相结合,全书读完,能知道要对数据作何种处理,为什么要这么做,并且对数据会有批判性,不盲目相信测序的数据结果。全书以问题引导式的方式来进行教学,看懂英文版的话能看到不少业内吐槽哈哈哈??(我已经快学完了,做了不少笔记,也记录了一些书本中的更新,一遍下来酣畅淋漓!!??)
    英文版biostar handbook :要付费哦,注册一下好像可以领16版免费的pdf,一些链接有点失效,使用工具可能有点过时,但可读性依然很强,毕竟经典理论经得起时间的推敲。
    国内授权翻译-生信媛:国人翻译的,微信公众号可看,美中不足,翻译的内容不是全的,大家按需看教程。
    biostar handbook
  • 生物信息学与功能基因组学:了解生物信息学中的算法,适合有一定基础并且想深入学习或者是研究中遇到情况需要探究生物信息工具原理的小伙伴阅读。
    生物信息学与功能基因组学中文影印版

习题集

其他学习网站

编程语言学习
python:codecademy.com/learn/learn-python
datacamp:(一个互动式学习网站,需要付费,R包现在增加了)
coursera 入门课程:programming meets biology (coursera free),基因组数据科学
edx : R statistic for biology (哈佛出品)
加拿大的生信研究所课程

想多接触英文教程的或者海外的同志考虑一下这些网站吧

上面的资料选一个自己看完,多练习,不做实验敲敲代码解解压!

踩坑不易,看官不来个赞吗???

知乎地址:https://zhuanlan.zhihu.com/p/399140821

最后编辑于
?著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 214,029评论 6 493
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 91,238评论 3 388
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事?!?“怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 159,576评论 0 349
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 57,214评论 1 287
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 66,324评论 6 386
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 50,392评论 1 292
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 39,416评论 3 412
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 38,196评论 0 269
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 44,631评论 1 306
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 36,919评论 2 328
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 39,090评论 1 342
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 34,767评论 4 337
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 40,410评论 3 322
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 31,090评论 0 21
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 32,328评论 1 267
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 46,952评论 2 365
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 43,979评论 2 351

推荐阅读更多精彩内容