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欢迎来到 Nextflow 培训工作坊

我们很高兴能够与您一起探索使用 Nextflow 编写可重复和可扩展的科学工作流程的道路。本指南是 Nextflow 完整文档的补充 - 如果您有任何疑问,请转到此处的文档

在本课程结束时,您应该:

  1. 能够熟练编写 Nextflow 工作流程
  2. 了解基本的 Nextflow 概念,如通道、进程和操作符
  3. 了解容器化工作流程
  4. 理解 Nextflow 支持的不同执行平台
  5. 认识 Nextflow 社区和生态系统

概述

为了让您尽快开始使用 Nextflow,我们将按照以下步骤进行:

  1. 设置开发环境以运行 Nextflow
  2. 使用一些基本的工作流程(包括多步骤的 RNA-Seq 分析)探索 Nextflow 概念
  3. 构建和使用 Docker 容器来封装所有工作流程依赖项
  4. 深入了解核心 Nextflow 语法(sytax),包括通道(Channels)、进程(Processes)和操作符(Operators)
  5. 涵盖集群和云部署方案,并探索 Nextflow Tower 的功能
  6. 这将让您全面了解 Nextflow,以开始编写自己的工作流程。我们希望您喜欢这门课程!这是一个不断发展的文档 - 欢迎反馈意见。
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